科技处5月13日（周二）讲座通知
基因组学与信息重点尝试室
例会学术汇报
汇报一：从基因组进化看细菌陆生化
汇报人：吴浩博士 章张组
汇报提要：
水和泥土是天然界中微生物生涯的根基环境，与水环境相比，泥土环境极度不不变，重要表此刻水分欠缺、营养匮乏、辐射严重等，因而不利于微生物的生计，但长功夫的进化却赋予细菌战胜泥土环境的各种“兵器”，形成了与水生菌截然分歧的泥土菌群。恒定泥土菌群（Terrabacteria）的存在现已被宏基因组学（Metagenomics）钻研宽泛证实，其优势菌群重要蕴含变形菌门（Proteobacteria）、放线菌门（Actinobacteria）、酸杆菌门（Acidobacteria）、浮霉菌门（Planctomycetes）以及疣微菌门（Verrucomicrobia）。现今的主流假说以为细菌是由水中慢慢过渡到陆地环境中的，然而对水生菌是怎么实现陆生化的过程却一知半解，并且为什么是上述细菌而不是其它菌门的细菌成功登“陆”也不得而知。在本汇报中我们将通过比力基因组学分析、宏基因组学分析及进化分析对这些问题进行探求。
汇报二：组学大数据整合和信息挖掘
汇报人：章张 钻研员
汇报提要：
高通量测序技术的迅猛发展推动性命科学进入到多组学大数据时期，这使得传统的数据存储、整合和挖掘步骤已无法适应海量生物数据的处置需要。云推算（Cloud Computing）可援手实现生物大数据的治理和分析，而Hadoop是一套云平台构建的开源软件框架，利用Hadoop提供的散布式并行推算框架MapReduce和散布式文件系统HDFS，可实现大数据的散布式存储和并行分析。同时，生物审编（Biocuration）是生物大数据整合的关键，不仅蕴含生物数据自身的整合，还蕴含海量文件内有关信息的组织和整顿，是国际生物数据中心（蕴含NCBI和EBI）成功的关键成分之一。本汇报将介绍本课题组在成立开发的基于Hadoop的生物大数据整合和挖掘平台Qomo（http://cloud.big.ac.cn）以及面向以水稻为代表的我国重要经济农作物的多组学数据资源库RiceWiki（http://ricewiki.big.ac.cn）。
主持人：章 张 钻研员
功夫： 2014年5月13日（星期二）上午10:00-11:30
地址：北京基因组钻研所一楼会议厅
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迎接参与！
例会学术汇报
汇报一：从基因组进化看细菌陆生化
汇报人：吴浩博士 章张组
汇报提要：
水和泥土是天然界中微生物生涯的根基环境，与水环境相比，泥土环境极度不不变，重要表此刻水分欠缺、营养匮乏、辐射严重等，因而不利于微生物的生计，但长功夫的进化却赋予细菌战胜泥土环境的各种“兵器”，形成了与水生菌截然分歧的泥土菌群。恒定泥土菌群（Terrabacteria）的存在现已被宏基因组学（Metagenomics）钻研宽泛证实，其优势菌群重要蕴含变形菌门（Proteobacteria）、放线菌门（Actinobacteria）、酸杆菌门（Acidobacteria）、浮霉菌门（Planctomycetes）以及疣微菌门（Verrucomicrobia）。现今的主流假说以为细菌是由水中慢慢过渡到陆地环境中的，然而对水生菌是怎么实现陆生化的过程却一知半解，并且为什么是上述细菌而不是其它菌门的细菌成功登“陆”也不得而知。在本汇报中我们将通过比力基因组学分析、宏基因组学分析及进化分析对这些问题进行探求。
汇报二：组学大数据整合和信息挖掘
汇报人：章张 钻研员
汇报提要：
高通量测序技术的迅猛发展推动性命科学进入到多组学大数据时期，这使得传统的数据存储、整合和挖掘步骤已无法适应海量生物数据的处置需要。云推算（Cloud Computing）可援手实现生物大数据的治理和分析，而Hadoop是一套云平台构建的开源软件框架，利用Hadoop提供的散布式并行推算框架MapReduce和散布式文件系统HDFS，可实现大数据的散布式存储和并行分析。同时，生物审编（Biocuration）是生物大数据整合的关键，不仅蕴含生物数据自身的整合，还蕴含海量文件内有关信息的组织和整顿，是国际生物数据中心（蕴含NCBI和EBI）成功的关键成分之一。本汇报将介绍本课题组在成立开发的基于Hadoop的生物大数据整合和挖掘平台Qomo（http://cloud.big.ac.cn）以及面向以水稻为代表的我国重要经济农作物的多组学数据资源库RiceWiki（http://ricewiki.big.ac.cn）。
主持人：章 张 钻研员
功夫： 2014年5月13日（星期二）上午10:00-11:30
地址：北京基因组钻研所一楼会议厅
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