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北京基因组所(国度生物信息中心)多组学数据资源系统建设持续获得重要进展

  近日 ,亚星游戏(国度生物信息中心)国度基因组科学数据中心(CNCB-NGDC)的多组学数据资源系统年度成就在国际生物数据库顶级期刊《核酸钻延追(Nucleic Acids Research)在线颁发。至此 ,CNCB-NGDC共有10篇论文入选将于2023年1月正式出版的《核酸钻延追2023年度数据库专刊 ,在生物数据库领域持续位于国际第一方阵。 

  2022年 ,CNCB-NGDC与共建单元以及30多家合作单元亲昵合作 ,持续更新和美满主题数据库资源(GSA、GWH、GVM、GEN、MethBank、LncRNA、RCoV19等) ,并开发了多个全新数据库(基因序列数据库GenBase ,猴痘病毒基因组信息库MpoxVR ,新冠病毒知识图谱数据库KGCoV ,原核生物泛基因组数据库ProPan ,人类癌症可变剪接知识库ASCancer Atlas ,全转录组关联钻研知识库TWAS Atlas ,脑数据资源库Brain Catalog ,个别癌症基因组数据库CCAS ,同源基因数据库HGD ,热带作物组学数据库TCOD等) ,进一步拓展了涵盖基础组学、国度人类遗传、重要战术生物、病毒等资源信息库以及生物信息在线分析工具等在内的多组学数据资源系统 ,为国度基因组科学数据的汇交共享、安全治理和挖掘利用提供了重要支持。 

  CNCB-NGDC汇聚全球数据 ,免费为国内表用户提供一站式多组学数据汇交和存储服务 ,颁布的数据编号被Springer Nature、Elsevier、Wiley、Taylor & Francis、Cell等全球重要出版集团认可。截至2022年12月20日 ,组学原始数据治理系统(GSA Family)已支持各类科技项目10900多个 ,汇交数据量近19PB ,来自754家单元3500名用户 ,有关数据已颁发在457种国内表期刊的近2000篇文章。2022年7月起CNCB-NGDC承担国度人类遗传资源信息治理备份平台运行守护工作 ,实现国度人类遗传资源信息一体化治理、备份、颁布与共享。新冠病毒信息库(RCoV19)不休更新 ,目前已收录新冠病毒序列超1400万条 ,为全球181个国度/地域240多万名访客提供数据服务 ,累计数据下载达100多亿条 ,在新冠病毒演化分析、监测、溯源等方面阐扬了重要作用 ,入选2022年世界互联网当先科技成就手册。

  CNCB-NGDC的建设得到科技部、财政部、亚星游戏、国度天然科学基金委、一带一路国际科学组织同盟、国际生物科学结合会等的赞助。

  CNCB-NGDC在《核酸钻延追2023年数据库专刊颁发的论文: 

  1.CNCB-NGDC数据库资源(整体介绍文章) 

  2.原核生物泛基因组数据库ProPan  

  3.全转录组关联钻研知识库TWAS Atlas 

  4.细胞分类库Cell Taxonomy 

  5.同源基因数据库HGD 

  6.人类癌症可变剪接知识库ASCancer Atlas 

  7.脑数据资源库Brain Catalog 

  8.动植物基因组变异与表型关联知识库GWAS Atlas v2.0 

  9.DNA甲基化数据库MethBank 4.0 

       10.人类长非编码RNA数据库LncBook 2.0

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CNCB-NGDC多组学数据资源系统(Nucleic Acids Res 2023)

 

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  GSA数据增长图 

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