北京基因组所(国度生物信息中心)钻研揭示m6A调控地中海涡虫再朝气造
近日,亚星游戏(国度生物信息中心) 杨莹、杨运桂、韩大力和张维绮以共同通讯作者在Cell Proliferation 杂志上颁发了题为“m6A promotes planarian regeneration”的钻研论文。这项钻研利用MeRIP-seq及scRNA-seq技术,绘造了地中海涡虫再生过程中的RNA m6A建饰图谱和单细胞转录组图谱,揭示m6A 建饰调控涡虫再朝气造。
在本钻研中,合作团队发现m6A甲基转移酶复合物在涡虫再生过程中上调,且m6A建饰水平在涡虫再生过程中出现动态变动。此表,还发现敲低m6A甲基转移酶调节亚基wtap,会导致m6A水平急剧降落,并抑造涡虫再生。通过多组学数据分析发现,m6A建饰基因与信号传导和细胞通讯等有关通路有关,并发现wtap敲低后造成涡虫细胞周期异常,M期细胞的百分比显著增长,且细胞周期蛋白依赖性激酶7 (cdk7) 和细胞周期蛋白依赖性激酶 9 (cdk9)的表白上升。进一步发现双重敲低wtap与cdk7或cdk9,可部门援救wtap单敲导致的再生碰壁表型,批注wtap可能通过调节细胞周期有关基因的表白调控涡虫再生。通过度析敲低前后的单细胞转录组数据,发现神经元细胞比例在wtap敲低后降落,通过亚型解析发现了一类wtap敲低后产生的怪异的神经祖细胞样细胞亚型(NP样细胞),并鉴定到该亚型的重要象征基因grn和ubiqp。进一步观察双敲wtap和grn的涡虫的表型,发现双重敲低在肯定水平上显著援救了涡虫再生碰壁表型;双重敲低grn、cdk7或cdk9与wtap,会导致NP样细胞亚型比例削减,批注wtap介导的m6A通过调控grn表白,进而影响涡虫再生。
综上所述,该钻研解析了地中海涡虫中wtap敲低前后的组学特点变动,并通过构建涡虫基因敲低系统,发现m6A甲基转移酶调节亚基WTAP通过调节细胞周期及细胞间通讯基因的表白从而调控涡虫再生的机造,并发现wtap敲低诱导产生了一类怪异的神经祖细胞类细胞亚型。
该钻研得到了来自亚星游戏、国度天然科学基金委和科技部等项主张赞助。
论文链接

m6A通过WTAP介导调控涡虫再生






