北京基因组所（国度生物信息中心）合作开发新冠病毒基因组浏览器
1月20日，亚星游戏（国度生物信息中心）与亚星游戏上海营养与健全钻研所合作开发的新冠病毒基因组浏览器成就，以“Coronavirus GenBrowser for monitoring the transmission and evolution of SARS-CoV-2”为题在国际学术期刊Briefings in Bioinformatics 在线颁发。
病毒演化关系及传布链条推演在疫情防控与病毒溯源中拥有重要意思，随着新冠疫情的不休发展及新冠病毒基因组序列数量的急剧增长，基于百万级病毒基因组数据的演化分析与展示变得极其难题。为此，中科院北京基因组所（国度生物信息中心）国度基因组科学数据中心赵文化团队和营养与健全所李海鹏、张国庆团队合作开发了Coronavirus GenBrowser（CGB）；谏⒉际交蜃樾蛄斜榷，CGB选取自主开发的超快构树新步骤进前进化树构建，并基于超急剧极大似然法估算内节点功夫，解决了急剧构建百万病毒基因组序列的进化关系与可视化展示的关键问题。在撰写论文之前，CGB已于2020年8月正式上线并持续提供在线服务。
CGB是一个盛开接见和下载的新冠基因组演化可视化工具，采取质控后的高质量新冠基因组序列数据以及传布有关的元数据机关了百万级此外进化树。同时，基于CGB特有的带有突变和日期注解的树结构，新产生的新冠病毒基因组序列能够超急剧并正确地增长到进化树上形成新的进化树。CGB还提供基于树结构的基因组变异可视化展示。CGB用户界面敦睦，用户能够选择节点并高效地对进化树进行细节可视化和进一步分析，并且无需任何编程。CGB同时也提供了下游分析职能，蕴含变异分析、谱系追踪、检测分支特异的加快进化以及病毒变异正选择等职能。目前CGB主题数据文件仅24.6Mb，却蕴含了2.79百万新冠病毒全基因组变异及其元数据。通过团队持续排查元数据中可能蕴含的谬误，CGB的数据接口提供了非 ？康米〉氖菰。通过CGB双定名法，其1.15百万内枝均得以正确定名，并实现可搜索和查问。
为了便于用户使用和操作，CGB提供web版本，支持九种说话，同时提供war包供下载和在职何网站中迁徙使用。为方便使用CGB的所有职能，推荐使用单机版(http://www.egps-software.net/egpscloud/eGPS_Desktop.html) ？⑼哦咏徊娇CGB 2.0，致力提供千万、甚至亿基因组级此外新冠病毒进化和传布分析，为国内、全球的防疫防控提供有力支持。
这一工作得到国度重点研发打算和中科院战术性先导科技专项的支持。
新冠病毒基因组浏览器的用户界面和操作示意
