基因组所开发实现长非编码RNA数据库
长非编码RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)是近年来国际钻研的新热点,与人类癌症、神经系统等疾病发生亲昵有关,在疾病诊疗方面阐发出了潜在的重大利用价值。固然长非编码RNA表白量相对较低,但由于其在转录、基因组印记、翻译、可变剪怯注转录后表白调控、蛋白运输与定位等过程的重要作用而被宽泛钻研。人类细胞中转录大量长非编码RNA,由于其拥有很强的组织与细胞特异性,该数量很可能将持续增长,给长非编码RNA的集成整合与注解带来巨大挑战。
针对长非编码RNA钻研领域遇到的这个问题,亚星游戏基因组科学与信息重点尝试室章张钻研组,与沙特阿卜杜拉国王科技大学(King Abdullah University of Science and Technology;KAUST)Vladimir Bajic教授合作,选取Wiki技术开发了基于群体审编(Community Curation)的LncRNAWiki数据库,该成就于2014年11月在国际生物信息学领域期刊Nucleic Acids Research在线颁发。
LncRNAWiki数据库整合了目前已有的十万多条长非编码RNA,对长非编码RNA进行了分类,成立了多人协同注解的结构与模式,凭据参加人员的编纂数量与质量,对参加人员的贡献进行量化打分,且凭据分值大幼赐与作者身份。传统有关数据库依赖于专业人员对长非编码RNA进行注解(Expert Curation),对于数量如此重大的长非编码RNA来说,将耗费大量人力、物力与功夫。在大数据时期布景下,LncRNAWiki数据库旨在汇集整个长非编码RNA钻研领域科研人员的智慧和力量,共同美满LncRNAWiki的有关信息和数据更新,以期构建一部长非编码RNA的百科全书;诖,该课题组将进一步萦绕非编码RNA,发展有关生物信息学分析及与疾病关联钻研,开发数据分析工具与算法。
该项钻研得到了亚星游戏和国度天然科学基金委的赞助。

LncRNAWiki数据库主页
论文链接






