基因组所急性白血病转录组钻研获进展
混合谱系白血。Mixed Lineage Leukemia,MLL)是一类恶性水平高、预后差的难治性急性白血病,因染色体易位形成MLL融合蛋白而得名。MLL融合蛋白激活下游一系列在血细胞分化和发育过程中起关键作用的基因表白,继而引发造血细胞的发育错乱和分化滞碍,最终导致白血病。
固然MLL融合蛋白在MLL致病机造中极度重要,但是单有MLL融合蛋白不及以引起MLL白血病。是否存在其它关键的独立致病因子,与MLL融合蛋白平行或产生交互作用,一向是白血病领域中广受关注的问题。近日,北京基因组所基因组变异与精准生物医学尝试室王前飞钻研员和美国辛辛那提儿童医院黄冈博士钻研组合作,在该方向上获得重要进展,有关论文在肿瘤钻研领域前沿期刊Leukemia杂志上颁发。
该钻研发现,与以往钻研中转录因子PU.1在t(8;21)和t(15;17)急性白血病钟装抑癌基因”的作用相反,PU.1在MLL白血病中高表白,并证实了PU.1在幼鼠MLL白血病模型中拥有诱发和维持肿瘤细胞成长的作用,并且PU.1不是MLL融合蛋白的下游靶基因。
为了进一步索求PU.1在MLL白血病中的致病机造,该钻研利用高通量测序伎俩对白血病转录组发展系统索求。通过对全基因组ChIP-seq数据及转录组数据的整合分析鉴定出一组直接受PU.1调控的表白印迹。在生物学职能方面,这个由15个靶基因组成的表白印迹别离对应到细胞成长、造血分化及炎性反映等重要生物学通路上。极度有趣的是,这15个受PU.1调控的靶基因中蕴含了MLL融合蛋白下游的MEIS-HOX通路上的关键调控因子。最终,利用大规模急性白血病病人的临床生计数据,该钻研证实PU.1调控的表白印迹在病人生计预后方面拥有重要的预测作用。
MLL白血病的病因和发病机造目前仍不是极度明确,但转录调控错乱是推进白血病形成的一个重要成分。该钻研在MLL白血病的转录调控机造钻研方面进行了创新的索求,与以往钻研中以为PU.1是抑癌基因分歧,科研人员发现转录因子PU.1拥有维持MLL白血病的作用,在作用机造方面, PU.1是独立于MLL融合蛋白的关键调控因子。PU.1除了自己独有的转录调控靶基因以表,还与MEIS1协同作用,共同调控血细胞分化发育的重要基因。该钻研为MLL白血病的临床诊断、预后评估及靶向医治提供了新的线索。

转录因子PU.1在MLL白血病中的调控模式图






