亚星游戏

基因组蛋白质组与生物信息学报首批在线预颁发文章上线

近日 ,由亚星游戏主办的全英文学术期刊——《基因组蛋白质组与生物信息学报》(Genomics, Proteomics & Bioinformatics, GPB) ,首批在线预颁发(Article-in-Press)文章成功上线。这次该刊物在线预颁发职能的开明与使用 ,对于援手科研人员实时颁发自己的最新钻研成就 ,使读者急剧相识国内表的最新钻研进展 ,以及提升GPB期刊的影响力都将起到积极作用。

自2003年创刊的近十年来 ,GBP一向遵循传统定期颁发文章的出版模式 ,但随着人们对信息时效性的需要日益增长 ,为了缩短文章的颁发周期 ,改善定期出版期刊的滞后性 ,从2012年6月起头 ,GPB将所有经过同业评议被接受的稿件 ,在ScienceDirect数据库中率先以在线预颁发的大局提前颁发 ,让文章更早地与读者碰头 ,供各人阅读、引用。本期首批预颁发的7篇文章 ,各人可通过以下介绍先见为快:

1.  本刊主编于军钻研员就其十五年来关于基因组转录方面的钻研成就颁发了简短评论 ,对一些问题进行了更深刻的思虑 ,并对一些传统概想提出了新的挑战。

2.  全基因组序列分析是生物信息学和推算生物学钻研的基础 ,Bilal Wajid等人对从前数十年Genome Assembler的钻研工作进行了总结 ,对二代测序技术的通常算法特点进行了综述 ,为入门者和感兴致人员相识能力域提供了很好的援手。

3.  在于军钻研员和胡松年钻研员的领导下 ,崔鹏、刘万飞、赵宇慧等人对三甲基化组蛋白H3赖氨酸4(H3K4me3)进行了钻研。他们通过比力幼鼠大脑和睾丸组织中H3K4me3、H3K27me3的基因组图谱 ,发现该基因建饰与组织特异性表白、职能和发育亲昵有关。

4.  以上钻研幼组的钻研还发现H3K4me3在正义基因3′端有显著富集 ,被称为3′-H3K4me3 ,3′-H3K4me3区域可能是作为反义转录的潜在启动子而阐扬作用 ,而这一景象可能在真核生物中普遍存在。

5.  幼麦白粉病是由于习染白粉病菌引起的 ,可导致幼麦减产。本刊编委王向峰教员与中国农业大学孙其信、解超杰教员等人合作 ,对两种分歧基因型(易赣注抗。┯茁笤诎追鄄【叭厩昂蟮囊镀辛俗甲楸攘ψ暄。了局批注 ,抗白粉病是一种由大量基因参加调控的极端复杂的系统反映。

6.水牛是一种重要六畜 ,但其全基因组序列信息尚需美满。Subhash J. Jakhesara等人利用水牛肌肉组织起源的cDNA作探针 ,从其基因组中捕获Tissue Specific Temporal表显子并进行454测序 ,以揭示该物种的肌肉组织特异性基因和单核苷酸多态性 ,为钻研尚未完玉成基因组测序物种的编码序列变异情况 ,提供了新的战术。

7.  非编码RNA(ncRNA)在转录水平调节基因表白方面起重要作用 ,但仍有很多ncRNA还有待进一步被发现。Michael Bao等人研发了一种基于ab initio的寻找基因组序列中ncRNA的新步骤——ncRNAscout。与传统步骤相比 ,该步骤由于参与了最幼自由能t-scores和SVP值这两个参数 ,因而能更精确地定位基因组中的ncRNA序列。该工具可在http://bioinformatics.njit.edu/ncRNAscout使用。 

注:如您想阅读文章全文 ,请登陆GPB期刊预颁发文章原文链接:http://www.sciencedirect.com/science/journal/aip/16720229.
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