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我国科学家实现鲤鱼全基因组序列图谱绘造

鲤科鱼类是我国最重要的水产养殖种类 ,年产量占我国淡水养殖总产量的70%以上 ,其中鲤鱼不仅是我国也是世界性的重要养殖鱼类 。5月6日 ,中国“鲤鱼基因组打算”学术汇报会暨新闻颁布会在京进行 。由中国水产科学钻研院水产生物利用基因组钻研中心、黑龙江水产钻研所和中科院北京基因组钻研所共同执行的“鲤鱼基因组打算”成功实现了鲤鱼全基因组测序 ,并绘造了鲤鱼基因组框架图谱、基因组物理图谱和高密度连锁图谱 ,为鲤鱼基因组辅助育种钻延注良好种类急剧造就提供了重要基础 。

鲤鱼基因组有100条染色体 ,是目前完玉成基因组测序钻研物种中染色体数量最多的动物 。这次颁布的鲤鱼基因组框架图 ,是以中国养殖最广的鲤鱼种类的雌核发育纯系单个个别为测序对象 ,测定了超过100倍覆盖率的高质量数据 。中科院北京基因组钻研所经过全基因组鸟枪法数据拼接和组装等多种技术蹊径 ,已经实现鲤鱼全基因组序列图谱绘造工作 。鲤鱼基因组大幼约为1.7Gb,拼接组装所获得的Scaffold的N50长度为404 kb 。此表 ,还产生了7万多条鲤鱼BAC克隆结尾序劣注166万条的表白序列标签和由8万多个BAC克隆组成的基因组物理图谱 ?蚣芡急鹄敫哺橇96.5%的BAC文库结尾序劣注96.2%的表白序列标签和95%的物理图谱 。

鲤鱼在我国有几千年的养殖汗青 ,经过长功夫的天然分化、人为选育 ,形成了状态多样、体色丰硕、有鳞无鳞、对特殊环境拥有较强适应性的多个处所种群和种类 ,使我国成为世界上鲤鱼种质资源和基因组资源最丰硕的国度 。据世界粮农组织统计 ,鲤鱼养殖产业全球年产量超过300万吨 。鲤鱼还是目前我国造就出种类最多的水产养殖种 ,在以利用基因组资源改进动植物经济性状为特点的现代农业育种技术发展过程中 ,鲤鱼是我国最有前提利用基因组资源进行种类改进的水产养殖物种 。从物种进化角度看 ,鲤鱼是已发展全基因组钻研物种中全基因组复造事务最多的物种 ,而全基因组复造作为生物基因组进化的重要汗青事务在现实物种的基因组中都留下重要证据 。因而 ,鲤鱼全基因组测序了局不仅对鲤鱼基因组辅助育种钻研 ,急剧造就抗病、抗逆、优质、高产的良好种类提供重要基础 ,并且对鲤科鱼类物种进化和种类分化的说明也拥有重要价值 。

鉴于鲤鱼基因组资源对鲤的育种钻研和基础钻研的重大意思 ,2009年底 ,中国水产科学钻研院水产生物利用基因组钻研中心、黑龙江水产钻研所结合亚星游戏启动了“鲤鱼基因组打算” ,经过1年多的受苦攻关 ,于今年4月底成功实现了蕴含基因组框架图、物理图谱和高密度连锁图谱在内的一系列成就 。该成就的实现,将使鲤鱼全基因组序列的装配了局与物理图谱和高密度连锁图谱实现整合 ,初步形成鲤鱼基因组精密图谱 ,使经济性状的遗传图谱定位逾越到基因组图谱和职能基因的精确定位 ,标志取鲤鱼分子育种等有关钻研正式进入基因组时期 ,这将必然推动鲤鱼育种技术的全面进取 。使人们有可能齐全把握经济性状形成的所有基因 ,如影响肉品质、影响肌间刺形成的基因 ,从而获得肉质好、肌间刺少的受迎接的新种类 。本钻研了局将有助于推动在基因组水平发展鲤鱼经济性状遗传机造和职能基因的精密钻研 ,推动基于基因组信息的水产育种技术的革命 。

科技部村落司综计算划处处长许增泰、农业部科教司政策系统处处长张国良、中科院农业项目办公室常务副主任段子渊、中科院北京基因组钻研所副所长于军、科技处处长严江伟 ,以及榆林大学林浩然院士、美国奥本大学刘占江教授、中科院海洋钻研所原所长相建海钻研员、中国海洋大学包振民钻研员、中国农业科学院作物科学钻研所毛龙钻研员、中国水产科学钻研院黄海水产钻研所陈松林钻研员等专家及新华社、中央电视台、科技日报、科学时报等新闻媒体记者40余人参与了汇报会和新闻颁布会 。
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“鲤鱼基因组打算”学术汇报会暨新闻颁布会
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鲤鱼基因组高密度连锁图谱

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